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実施例 NGS Library Prep Kit KODEasy 実施例6 混合微生物ゲノムDNAのシーケンス 混合微生物ゲノムDNA (ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard II(Log Distribution), ザイモリサーチ社)10ngから、GenNext® NGS Library Prep Kit -KODEasy®-でライブラリーを ...
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実施例 KOD One 実施例23 種々のPCR酵素によるPacBio新ワークフローの再評価 【データご提供】 株式会社 生物技研 様 PacBio社より発表された微量DNAからライブラリーを構築する新しいワークフローにおいて、DNAポリメラーゼに弊社のKOD FX [Code No. KFX-101]が採用されています。 KOD Xtreme、KOD FXを用いたPacBio社Ampli-Fiプ ...
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実施例 KOD FX Neo 実施例4 フミン酸添加実験 フミン酸(humic acid)とは、腐植土や土壌などに存在する赤褐色または黒褐色の有機物であり、PCRを阻害することが知られています。通常行われるDNAの精製ではこのフミン酸は除くことはできません。そのため、環境・生態系サンプルを鋳型としたPCRはとても難しいとされています。 ここでは、例としてヒトゲノムDNAにフミン酸を混合し、PCRの ...
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実施例 KOD FX Neo 実施例7 コンポスト(堆肥)を用いたメタゲノム解析 コンポスト(堆肥)から、さまざまな方法を用いて粗抽出したDNA溶液(処理上清)をサンプルとして、原核生物共通プライマーを用いてrDNAの増幅を行いました。その結果、アルカリ溶解法とワンステップ法で調製したサンプルを用いた検討において、一般的に広く行われているCTAB法と同程度の増幅を確認することができました(右図)。 ...
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実施例 KOD FX Neo 実施例8 マウス爪を用いたダイレクトPCR 微量かつクルードなサンプルの実施例としてマウスの爪からの直接PCRを実施しました。 マウスのジェノタイピングでは通常、血液や尾を使用しますが、マウスを傷つけてしまうという欠点がありました。爪を用いることでマウスを傷つけることなくジェノタイピングが可能になります。その方法を紹介いたします。 【サンプル】マウス爪 ●採取方法 マ ...
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実施例 KOD FX Neo 実施例9 ES細胞での遺伝子組換え判定 【データご提供】 群馬大学先端科学研究指導者育成ユニット 山本正道 先生 【サンプル】ES細胞のゲノムDNA 【サンプルの処理】 ES細胞をProKにて溶解した後、フェノール/クロロフォルム→クロロフォルム→イソプロパノール沈殿を行った後にTE溶液にて溶解した。 【遺伝子名】ROSA26領域に特定のcDNAを ...
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実施例 KOD SYBR™ qPCR Mix 実施例7 ゲノムDNA相対定量 【データご提供】 日本大学 薬学部 ゲノム創薬学研究室 小林 秀昭 先生 【結果】 1. 融解曲線 (鋳型DNA 5ng) KOD SYBR™ qPCR Mixでは融解曲線は1つのピークであったが、A社リアルタイムPCR試薬では複数のピークが認められた。 2. 増幅曲線 KOD SYBR™ qPC ...
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実施例 KOD SYBR™ qPCR Mix 実施例8 クルードサンプル(菌液)を用いたリアルタイムPCR 【データご提供】日本大学 薬学部 ゲノム創薬学研究室 小林 秀昭 先生 【実験結果】 1. 精製DNAと菌液の増幅曲線 赤:精製DNA 緑:菌液 菌液の増幅曲線の傾きは、精製DNAのものとほぼ一致した。 2. 精製DNAと菌液の融解曲線 赤:精製DNA 緑:菌液 菌液の融解曲線のパタ ...
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実施例 KOD SYBR™ qPCR Mix 実施例9 生物農薬糸状菌の特異的検出及び定量 【データご提供】 神戸大学大学院 農学研究科 生命機能化学専攻 細胞機能構造学研究室 池田 健一 先生 ・ 宿南 良 様 【実験結果】 1. A社qPCRキットでの結果 a. 増幅曲線 b. 融解曲線 2. KOD SYBR™ qPCR Mixでの結果 a. 増幅曲線 b. 融解曲線 水色: 5 ...
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実施例 KOD SYBR™ qPCR Mix 実施例10 ChIPターゲットの効果的な増幅 先生方からいただきました実施例を掲載いたしております。実験にお役立てください。 【結果】 各qPCR Mixの増幅曲線の比較 A社qPCRキット KOD SYBR™ qPCR Mix 【サンプル】 ヒトゲノムDNA 【サンプルの調製方法】QIAGEN社のQIAamp® DNA Mini Kitキ ...
