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実施例 THUNDERBIRD Next Probe 実施例5 阻害物質存在下でのマルチプレックスPCR② 3種類の蛍光色素で標識したTaqMan® probe を用いたマルチプレックス検出系にて、赤痢、VTEC 、サルモネラ菌のgDNAの検出を行いました。またPCRの阻害物質として、糞便や全血、唾液を添加した系でも検出を行いました。実験は取扱説明書の反応条件に従って実施し、検出はBio-Rad社 ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe 実施例6 UNG添加によるキャリーオーバーコンタミネーション防止効果 エンテロウイルスRNAを鋳型とし、dUTPを含むRT-PCR試薬で196bpのターゲットの増幅を行いました。そのPCR産物(10⁴コピー、10³コピー)を鋳型とし、THUNDERBIRD® Next Probe qPCR MixとUracil-DNA Glycosy ...
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実施例 THUNDERBIRD Next SYBR™ 実施例8 シグナル強度・PCR効率の他社品との比較 逆転写反応用試薬 ReverTra Ace® qPCR RT Kit [Code No.FSQ-101]により合成したHeLa細胞total RNA由来のcDNAを用い、cDNAの5倍希釈(6段階)について、伸長時間30秒の通常サイクルと伸長時間10秒の高速サイクルでβ-actinの ...
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実施例 RamDA-seq 実施例6 さまざまなインプットRNA量(2pg～6.25ng)からのRNA-seq解析 HeLa細胞から抽出したRNAを用いて、インプット量を2 pg～6.25 ngの範囲でライブラリー調製を行いました。cDNA合成には、NSR Primer Set for human [Code No. NSR-101]を使用し、ライブラリーエンリッチメントはすべて15サイクルで行い ...
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実施例 Shin-RamDA-seq 実施例5 さまざまなインプットRNA量(10pg～6.25ng)からのRNA-seq解析 ヒト白血病細胞株K562細胞から抽出したRNAを用いて、インプット量を10 pg～6.25 ngの範囲でライブラリー調製を行いました。 cDNA合成には、NSR Primer Set for human [Code No. NSR-101]を使用し、ライブラリーエンリッチ ...
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実施例 KOD FX Neo 実施例10 アジレント社 SureSelect XT HS2 ターゲットエンリッチメントシステムを用いた効率的なロングリードシーケンス解析 ロングリードシーケンシングは近年精度やスループットが向上し、Telomere-to-Telomere(T2T)コンソーシアムによる完全ヒトゲノムの解読にも貢献し、Method of the year 2022 に選ばれるなど注目を ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe One-step qRT-PCR 実施例3 さまざまなウイルスの検出感度の比較 TaqMan® probe を⽤いて5種類のウイルスRNAの最⾼検出感度を⽐較し検出された最も低いコピー数を各試薬ごとにプロットしました。解析には Applied Biosystems StepOnePlus™ を⽤いました。 本製品ではすべてのターゲッ ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe One-step qRT-PCR 実施例4 夾雑物耐性評価 50コピーのインフルエンザウイルスRNAを検出する系においてPCRを阻害する夾雑物である⽣体由来成分 (⾎漿、唾液、⿐腔ぬぐい液)を添加し、耐性を評価しました。解析には バイオラッド社 CFX96 Touch Deep Well を⽤いました。 その結果、他社試薬では夾雑物の添加で増幅 ...
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実施例 KOD FX Neo 実施例5 ワンステップ法で調製した植物ライセートからの増幅 ワンステップ法で調製したタバコの葉のライセートをサンプルとして検討を行いました。今回は、今までの検討で、35サイクルの条件ではあまり増幅の良くなかった、2.2 kb及び4.6 kbのターゲットを増幅しました。その結果、KOD FX Neoを用いることで、明瞭な増幅を確認することができました。 KOD FX N ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe One-step qRT-PCR 実施例5 マルチプレックス性能評価 4種類の蛍光⾊素で標識したTaqMan® probe を⽤いて、シングル検出とマルチプレックス検出を⽐較しました。鋳型にはHeLa S3 RNA (500ng〜0.05ngの10倍希釈[5段階]) を⽤いました。 解析には バイオラッド社 CFX96 Touch Deep W ...
