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実施例 RamDA-seq 実施例9 さまざまなインプットRNA量(2pg～6.25ng)からのRNA-seq解析 HeLa細胞から抽出したRNAを用いて、インプット量を2 pg～6.25 ngの範囲でライブラリー調製を行いました。cDNA合成には、NSR Primer Set for human [Code No. NSR-101]を使用し、ライブラリーエンリッチメントはすべて15サイクルで行い ...
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実施例 Shin-RamDA-seq 実施例5 さまざまなインプットRNA量(10pg～6.25ng)からのRNA-seq解析 ヒト白血病細胞株K562細胞から抽出したRNAを用いて、インプット量を10 pg～6.25 ngの範囲でライブラリー調製を行いました。 cDNA合成には、NSR Primer Set for human [Code No. NSR-101]を使用し、ライブラリーエンリッチ ...
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実施例 KOD FX Neo 実施例10 アジレント社 SureSelect XT HS2 ターゲットエンリッチメントシステムを用いた効率的なロングリードシーケンス解析 ロングリードシーケンシングは近年精度やスループットが向上し、Telomere-to-Telomere(T2T)コンソーシアムによる完全ヒトゲノムの解読にも貢献し、Method of the year 2022 に選ばれるなど注目を ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe One-step qRT-PCR 実施例3 さまざまなウイルスの検出感度の比較 TaqMan® probe を⽤いて5種類のウイルスRNAの最⾼検出感度を⽐較し検出された最も低いコピー数を各試薬ごとにプロットしました。解析には Applied Biosystems StepOnePlus™ を⽤いました。 本製品ではすべてのターゲッ ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe One-step qRT-PCR 実施例4 夾雑物耐性評価 50コピーのインフルエンザウイルスRNAを検出する系においてPCRを阻害する夾雑物である⽣体由来成分 (⾎漿、唾液、⿐腔ぬぐい液)を添加し、耐性を評価しました。解析には バイオラッド社 CFX96 Touch Deep Well を⽤いました。 その結果、他社試薬では夾雑物の添加で増幅 ...
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実施例 KOD FX Neo 実施例5 ワンステップ法で調製した植物ライセートからの増幅 ワンステップ法で調製したタバコの葉のライセートをサンプルとして検討を行いました。今回は、今までの検討で、35サイクルの条件ではあまり増幅の良くなかった、2.2 kb及び4.6 kbのターゲットを増幅しました。その結果、KOD FX Neoを用いることで、明瞭な増幅を確認することができました。 KOD FX N ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe One-step qRT-PCR 実施例5 マルチプレックス性能評価 4種類の蛍光⾊素で標識したTaqMan® probe を⽤いて、シングル検出とマルチプレックス検出を⽐較しました。鋳型にはHeLa S3 RNA (500ng〜0.05ngの10倍希釈[5段階]) を⽤いました。 解析には バイオラッド社 CFX96 Touch Deep W ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe One-step qRT-PCR 実施例6 キャリーオーバーによる偽陽性防止 ⾶沫した増幅産物が次のPCRに混⼊したケース(キャリーオーバーコンタミネーション)を想定し、本製品で増幅した産物(196bp) 103, 102コピー相当を鋳型として、UNG処理(+)/(-) の条件で同ターゲットの検出を⾏いました。 解析には Applied Bio ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe One-step qRT-PCR 実施例7 凍結乾燥前後での性能比較 プライマー・プローブを添加した反応液を凍結乾燥しました(右写真)。 凍結乾燥処理前後で、バイオラッド社 CFX96 Touch Deep Wellにて、1,500, 375, 94, 23, 6 コピーのインフルエンザウイルスRNAの検出を⾏いました。 その結果、凍結乾燥によ ...
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実施例 THUNDERBIRD Probe One-step qRT-PCR 実施例3 多色検出(Multiplex) 系での発現定量 3 種類の蛍光色素で標識したTaqMan® probe を用い、単独検出と、3 種類のTaqMan® probe を一度に用いるMultiplex 検出系にて、IL-β、TNF-α、GAPDH 遺伝子の発現量を解析しました。 実験にはHeLa ...
