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実施例 KOD Mutagenesis 実施例3 種々のサイズのプラスミドをターゲットとした場合の変異導入効率の評価 全長3.3kb～11.3kbの5種類のヒトcDNAクローン(FLJ cDNA Clone: Code No. FLJ-101)に対して、1塩基置換、3塩基欠失、6塩基挿入の変異導入をそれぞれ行い、シーケンシングにて変異導入効率の評価を行いました(変異箇所は、ベクター上の共通領域に設 ...
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実施例 Shin-RamDA-seq 実施例2 Shin-RamDA-seq Kitを用いたリードカバレッジ 平均化したヒト白血病細胞株K562細胞1細胞分からライブラリーを調製してRNA-seq解析を行い、Millefy*を用いてカバレッジを確認しました。Shin-RamDA-seq® Kitを使用したシングルセル解析で、20kb程度の長さを持つNEAT1_2 全長のカバレッジが確認でき、NEA ...
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実施例 Shin-RamDA-seq 実施例3 K562細胞の解析 Shin-RamDA-seq® Kitおよび他社対応Total RNA-seq試薬を用い、1細胞に平均化したヒト由来K562細胞からライブラリー調製を行いました。イルミナ社 MiSeq®を用いてNGS解析を行い、検出転写産物数・遺伝子、カバレッジを比較した結果、Shin-RamDA-seq® Kitの方が高い検出転写産物・遺伝子数 ...
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実施例 miRNAssay 実施例3 培養細胞ライセートからのmiRNA検出 SuperPrep® miRNAssay® Cell Lysis & RT Kit for qPCR [Code No. MIR-201] を⽤いて、K562 (ヒト慢性⾻髄性⽩⾎病細胞株)、HepG2 (ヒト肝癌由来細胞株)、A431 (ヒト上⽪様細胞癌由来細胞株)、Jurkat (ヒト⽩⾎病T細胞由来細胞株) ...
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実施例 miRNAssay 実施例4 エクソソームライセートからのmiRNA検出 SuperPrep® miRNAssay® Cell Lysis & RT Kit for qPCRを⽤い、HeLa細胞の培養上清から回収したエクソソーム(上清2mL回収分)をライセート化し、9種のmiRNA(let-7a, c, d, e, f, g, i, miR-21,103)特異的なステムループRTプ ...
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実施例 RNA-direct 実施例5 TaqMan® プローブアッセイにおけるマルチプレックス性能比較 RNA-direct ® Realtime PCR Master Mix -ROX Free-[Code No. QRT-101RF]を用い、RSウイルス、インフルエンザウイルス、SARS-CoV-2を検出するマルチプレックスPCRを行いました。検出にはTaqMan® Probeを用い、各RN ...
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実施例 KOD One 実施例21 次世代シーケンサー(NGS)を用いたSARS-CoV-2亜系統の分類 データご提供 塩野義製薬株式会社 ワクチン開発研究所 | ワクチン基盤研究1グループ 黒岩 美帆 様 <実験の目的> NGSを用いた、下水に含まれるSARS-CoV-2亜系統を正確な組成比で検出するための技術開発。その精度確認のため、最大7種類のSARS-CoV-2亜系統由来RN ...
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実施例 Shin-RamDA-seq 実施例4 FFPEからのNGS解析 1ngのFFPE由来のRNAから、GenNext® Shin-RamDA-seq® Single Cell Stranded Kit [Code No. RML-101]を用いて、ライブラリー調製を行い、RNA-Seqを行いました。RNA-Seqにはイルミナ社MiSeq®を使用しました。使用したFFPE、RNA-Seqの解析 ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe 実施例3 調製後の反応液の安定性 3種類の蛍光色素で標識したTaqMan® probe を用いたマルチプレックス検出系にて、赤痢、VTEC 、サルモネラ菌のgDNAの検出を行いました。 PCR反応液にプライマー、プローブ、テンプレートを混合した直後または遮光室温で48時間インキュベートした後に、取扱説明書のサイクル条件に従ってのターゲットの増幅 ...
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実施例 THUNDERBIRD Next Probe 実施例4 阻害物質存在下でのマルチプレックスPCR① 4種類の蛍光色素で標識したTaqMan® probe を用いたマルチプレックス検出系にて、β-actin 、GAPDH 、PLA、TUB遺伝子の検出を記載の阻害物質存在下で確認しました。 実験にはHeLa細胞total RNA由来のcDNAを4倍希釈[5段階]をサンプルとして用い、 ...
