実施例
THUNDERBIRD Next SYBR™ 実施例8 シグナル強度・PCR効率の他社品との比較
逆転写反応用試薬 ReverTra Ace® qPCR RT Kit [Code No.FSQ-101]により合成したHeLa細胞total RNA由来のcDNAを用い、cDNAの5倍希釈(6段階)について、伸長時間30秒の通常サイクルと伸長時間10秒の高速サイクルでβ-actinの増幅を行いました。
増幅曲線を他社試薬と比較した結果、THUNDERBIRD® Next SYBR™ qPCR Mixの方が他社試薬より高い蛍光値を示しました。またPCR効率も他社試薬より高く、低コピー領域まで安定した増幅が確認できました。
THUNDERBIRD® Next SYBR™ qPCR Mixでは高速サイクルでも低コピーまでの検出が可能であり、より迅速に高感度な解析を可能にします。
<伸長時間30秒の通常サイクル>
| cDNA (RNA相当量) |
THUNDERBIRD® Next SYBR™ qPCR Mix |
他社試薬 | ||
| 1ng | 19.20 | 19.07 | 19.47 | 19.30 |
| 0.2ng | 21.47 | 21.21 | 22.00 | 22.07 |
| 0.04ng | 23.96 | 23.69 | 26.51 | 24.91 |
| 0.008ng | 26.38 | 26.25 | 34.16 | 26.49 |
| 1.6pg | 29.16 | 28.75 | 35.06 | 30.92 |
| 0.32pg | 31.78 | 31.35 | N/A | 32.06 |
| 0.064pg | 35.14 | 33.59 | 38.84 | 34.59 |
| NTC | N/A | N/A | N/A | N/A |
| PCR効率 | 90.4% | 68.1% | ||
| 相関係数 | -0.999 | -0.911 | ||
<伸長時間10秒の高速サイクル>
| cDNA (RNA相当量) |
THUNDERBIRD® Next SYBR™ qPCR Mix |
他社試薬 | ||
| 1ng | 19.66 | 19.64 | 20.04 | 20.02 |
| 0.2ng | 22.04 | 21.85 | 22.29 | 22.24 |
| 0.04ng | 24.37 | 24.21 | 24.75 | 24.79 |
| 0.008ng | 26.69 | 26.50 | 27.10 | 27.47 |
| 1.6pg | 29.02 | 28.87 | 30.09 | 36.34 |
| 0.32pg | 32.09 | 32.07 | 32.17 | N/A |
| NTC | N/A | N/A | N/A | N/A |
| PCR効率 | 93.3% | 75.1% | ||
| 相関係数 | -0.998 | -0.933 | ||
