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コーヒーブレイク 「昼休みのベンチ」 Index こちらには過去に公開した読み物を掲載しています。情報としては古くて参考にはならないかもしれませんが、その時々の話題にからめた内容なっておりますので、懐かしく思い出しながら読んでいただければ幸いです。 切れていたリンクを修正したために掲載時とは異なるサイトを参照している場合がございます。また、機関名、会社名、所属、その他の情報が、現在は変わっている可 ...
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コーヒーブレイク 「西海岸。の風に吹かれて」 Index こちらには過去に公開した読み物を掲載しています。情報としては古くて参考にはならないかもしれませんが、その時々の話題にからめた内容なっておりますので、懐かしく思い出しながら読んでいただければ幸いです。 切れていたリンクを修正したために掲載時とは異なるサイトを参照している場合がございます。また、機関名、会社名、所属、その他の情報が、現在は変わっ ...
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コーヒーブレイク 「アメリカ東海岸留学日記」 Index こちらには過去に公開した読み物を掲載しています。情報としては古くて参考にはならないかもしれませんが、その時々の話題にからめた内容なっておりますので、懐かしく思い出しながら読んでいただければ幸いです。 切れていたリンクを修正したために掲載時とは異なるサイトを参照している場合がございます。また、機関名、会社名、所属、その他の情報が、現在は変わっ ...
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コーヒーブレイク 限界に挑戦 ! 伸長時間1秒でどのくらい増幅できるかやってみた ■はじめに KOD One® PCR Master Mixは高速PCRができる製品ですが、1秒でどこまで増幅できるのか? 製品性能ぎりぎりの限界に挑戦した結果をご紹介します。 ■実験方法 KOD One® PCR Master Mixで、伸長時間を1秒とし、1kb、2.5kb、5kb、10kbのターゲットの増幅を試み ...
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コーヒーブレイク 検証してみた!リアルタイムPCRにおいて増幅効率が最も良い増幅長ってどのくらい? ■はじめに リアルタイムPCRを行う上で、増幅長はどのくらいになるように設計するのが適切なのだろうか? 長すぎると上手くいかないイメージはあるものの、どれくらい増幅効率に影響しているのだろう? そんな素朴な疑問を検証するべく、今回は増幅長ごとの増幅効率について検証してみました。 ■実験方法 さまざま ...
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コーヒーブレイク SNP解析でお酒の代謝に関する遺伝子を調べてみた! ■はじめに アルコール(エタノール)はまず、肝臓内でアルコール脱水素酵素(ADH)などによって有害物質のアセトアルデヒドに分解されます。その後、アルデヒド脱水素酵素(ALDH)によって酢酸に分解され、最終的には、酢酸は全身に送られ、二酸化炭素と水に分解され、体外へ排出されます。 二日酔いの原因となる有害物質アセトアルデヒドを分解 ...
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コーヒーブレイク いろんな相補的プライマーを設計してプライマーダイマーが発生するか試してみた! ■はじめに リアルタイムPCRを実施する上で大切なプライマー設計。 実際にどのくらい相補性があるとプライマーダイマーが発生してしまうのか? さまざまな相補的プライマーを設計して試してみました。 ■実験方法 以下1F～2Fフォワードプライマーと1R～5Rのリバースプライマーを設計し、予めホットスタート用抗 ...
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コーヒーブレイク Long PCRで KODにぴったりのPrimer長を探してみた! ■はじめに 皆さんはPrimerをどのくらいの長さで設計していますか? 配列はもちろん、長さもPrimerを設計する上で重要なポイントですよね。 今回は、Long PCRでPrimerの長さを2merずつ変えて、どの長さが一番KODにぴったりなのか検証してみました! ■実験方法 40merから18merまで2ba ...
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コーヒーブレイク qPCR試薬、プライマーとテンプレートを入れてどのくらい放置しても大丈夫? ■はじめに リアルタイムPCRの際、「調製に時間がかかっているけど大丈夫かな…」とか「試薬調製しちゃったけど、ちょっと実験止めたい!」と思ったことはありませんか? 今回は、実際のところ反応液を放置したらどうなるのか、研究員に試してもらいました。 ■実験方法 当社の2種類の製品(THUNDER ...
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コーヒーブレイク PCRであえてアニーリング温度を下げたらどうなるか試してみた! ■はじめに PCRにおいてサイクル条件の温度はとても大切なポイントですよね! アニーリング温度は、高いと特異性が高くなるが収量が低下し、低いと収量は増加するが特異性が低下すると言われます。 今回はKOD One® PCR Master Mix -Blue- [Code No. KMM-201] を用いて、あえてアニー ...
