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コーヒーブレイク 限界に挑戦 ! 伸長時間1秒でどのくらい増幅できるかやってみた ■はじめに KOD One® PCR Master Mixは高速PCRができる製品ですが、1秒でどこまで増幅できるのか? 製品性能ぎりぎりの限界に挑戦した結果をご紹介します。 ■実験方法 KOD One® PCR Master Mixで、伸長時間を1秒とし、1kb、2.5kb、5kb、10kbのターゲットの増幅を試み ...
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コーヒーブレイク コーヒーブレイク お楽しみコラム「ヒミツの実験レポート」 研究所ではさまざまな検討、実験を経て製品開発していますが、公開されているのはごくわずか。 日々試薬と向き合い、性能を精査する研究員たちのヒミツの実験レポートを、ちょっとばかりご紹介するシリーズ。 これらの実験は推奨条件ではないことをご了承の上、ご覧ください。 ヒミツの実験レポート 研究員たちのさまざまな検討、実験のご紹介 ...
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コーヒーブレイク 検証してみた!リアルタイムPCRにおいて増幅効率が最も良い増幅長ってどのくらい? ■はじめに リアルタイムPCRを行う上で、増幅長はどのくらいになるように設計するのが適切なのだろうか? 長すぎると上手くいかないイメージはあるものの、どれくらい増幅効率に影響しているのだろう? そんな素朴な疑問を検証するべく、今回は増幅長ごとの増幅効率について検証してみました。 ■実験方法 さまざま ...
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コーヒーブレイク SNP解析でお酒の代謝に関する遺伝子を調べてみた! ■はじめに アルコール(エタノール)はまず、肝臓内でアルコール脱水素酵素(ADH)などによって有害物質のアセトアルデヒドに分解されます。その後、アルデヒド脱水素酵素(ALDH)によって酢酸に分解され、最終的には、酢酸は全身に送られ、二酸化炭素と水に分解され、体外へ排出されます。 二日酔いの原因となる有害物質アセトアルデヒドを分解 ...
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コーヒーブレイク いろんな相補的プライマーを設計してプライマーダイマーが発生するか試してみた! ■はじめに リアルタイムPCRを実施する上で大切なプライマー設計。 実際にどのくらい相補性があるとプライマーダイマーが発生してしまうのか? さまざまな相補的プライマーを設計して試してみました。 ■実験方法 以下1F～2Fフォワードプライマーと1R～5Rのリバースプライマーを設計し、予めホットスタート用抗 ...
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コーヒーブレイク Long PCRで KODにぴったりのPrimer長を探してみた! ■はじめに 皆さんはPrimerをどのくらいの長さで設計していますか? 配列はもちろん、長さもPrimerを設計する上で重要なポイントですよね。 今回は、Long PCRでPrimerの長さを2merずつ変えて、どの長さが一番KODにぴったりなのか検証してみました! ■実験方法 40merから18merまで2ba ...
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コーヒーブレイク qPCR試薬、プライマーとテンプレートを入れてどのくらい放置しても大丈夫? ■はじめに リアルタイムPCRの際、「調製に時間がかかっているけど大丈夫かな…」とか「試薬調製しちゃったけど、ちょっと実験止めたい!」と思ったことはありませんか? 今回は、実際のところ反応液を放置したらどうなるのか、研究員に試してもらいました。 ■実験方法 当社の2種類の製品(THUNDER ...
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コーヒーブレイク PCRであえてアニーリング温度を下げたらどうなるか試してみた! ■はじめに PCRにおいてサイクル条件の温度はとても大切なポイントですよね! アニーリング温度は、高いと特異性が高くなるが収量が低下し、低いと収量は増加するが特異性が低下すると言われます。 今回はKOD One® PCR Master Mix -Blue- [Code No. KMM-201] を用いて、あえてアニー ...
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コーヒーブレイク ボルテックスってどれくらいまでかけたらダメなの? ■はじめに よく酵素はボルテックスをかけてもいいですか? というお問い合わせをいただきます。 ボルテックスをかけてはいけないというイメージがありますが、どれくらいまでなら問題ないのか試してみました。 ■実験方法 逆転写試薬ReverTra Ace® qPCR RT Master Mix [Code No.FSQ-201] とHeL ...
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コーヒーブレイク お楽しみコラム 「ヒミツの実験レポート」 Index (最新レポート) さまざまなRNA量からRNA-seqをしてみた! (過去のレポート) 増幅しにくいターゲットを増幅してみた! 微量RNAからの発現解析! cDNAを増やす方法を検討してみた! 冷凍庫に眠っているqPCR試薬を使ってみた! リアルタイムPCRマスターミックス試薬の添加量を変えて実験してみた! NGSライブラリー ...
