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コーヒーブレイク DNAメチル化解析でお困りの方へ! ■はじめに 遺伝子発現調整に深く関わるメチル化の解析は、エピゲノムの分野でよく行われる解析です。しかし、DNAのメチル化解析において、バイサルファイト処理や酵素処理をした鋳型からのPCRがうまくいかなかったことはないですか? バイサルファイト後の鋳型は断片化されていることが多く、また非メチル化シトシンから変換されたウラシルもPCRを阻害すること ...
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コーヒーブレイク PCR試薬にいろんな色を付けてみた! ■はじめに 実験がうまくいかない…課題が終わらない…人生、山あり谷ありですよね! 研究に疲れを感じ始めたとき、PCR試薬をカラフルにして気分を上げてみませんか? 最近、色素入りのPCR試薬が各社から販売されていますね。 反応液に色がついているため、PCR後にそのまま電気泳動が可能です。ローディングバッファーを加える ...
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コーヒーブレイク アダプターダイマーを減らすライブラリー調製のコツ! ■はじめに このたび、東洋紡から新しくDNA-seq用のライブラリー調製キット「GenNext® NGS Library Prep Kit -KODEasy® -[Code No. LPK-201]」が発売されました! 末端修復やライブラリー増幅には弊社独自のKOD酵素を応用しており、従来製品に比べて操作性を大幅に向上させており ...
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コーヒーブレイク 細胞から直接cDNA合成してバラツキを比較してみた! ■はじめに 96ウェルプレートで培養した細胞などサンプル数が多いと、RNA抽出は時間も手間もかかって大変ですよね、そのお悩み解決できます! 弊社SuperPrep®を使えば、細胞から精製することなくcDNA合成が可能です。さらに、さまざまなリアルタイムPCR試薬(SYBR™ Green I、TaqMan®アッセイ両 ...
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コーヒーブレイク qPCR試薬の蛍光強度を比較してみた! ■はじめに qPCRの蛍光強度、普段どの程度意識されていますか? qPCRの結果を評価する際、Ct値や増幅曲線に注目される方は多いかと思いますが、実は蛍光強度も重要な指標のひとつです。 蛍光強度が高いと、Ct値の判定が安定しやすくなり、ピペッティング誤差などの技術的なばらつきにも強く、再現性の高い定量が可能になります。しかしながら、この点は ...
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コーヒーブレイク ロング PCR の特異性を上げるコツ! ■はじめに 近頃はショートリードだけでなく、ロングリードシーケンスも盛んに行われるようになりましたね。中でも、特定の領域をPCRによって増幅してシーケンスするアンプリコンシーケンスは、コストやデータ量を抑えて特定の領域を解析できる手法です。 ただ、ロングPCRの際に、バンドがスメアになる、目的以外のバンドが出る、といった経験をした方も多いの ...
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コーヒーブレイク ロング PCR の特異性を上げるコツ! qPCR試薬の蛍光強度を比較してみた! 細胞から直接cDNA合成してバラツキを比較してみた! アダプターダイマーを減らすライブラリー調製のコツ! PCR試薬にいろんな色を付けてみた! DNAメチル化解析でお困りの方へ! さまざまなRNA量からRNA-seqをしてみた! 増幅しにくいターゲットを増幅してみた! 微量RNAからの発現解析! cD ...
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コーヒーブレイク ロング PCR の特異性を上げるコツ! qPCR試薬の蛍光強度を比較してみた! 細胞から直接cDNA合成してバラツキを比較してみた! アダプターダイマーを減らすライブラリー調製のコツ! PCR試薬にいろんな色を付けてみた! DNAメチル化解析でお困りの方へ! さまざまなRNA量からRNA-seqをしてみた! 増幅しにくいターゲットを増幅してみた! 微量RNAからの発現解析! cD ...
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コーヒーブレイク 「再三 西海岸。の風に吹かれて」 第25回 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第24回 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第23回 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第22回 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第21回 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第20回 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第19回 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第18回 「続々:西海岸。の風に吹かれて ...
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コーヒーブレイク 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第15回 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第14回 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第13回 「西海岸。の昭和!実験奮闘記」(続西海岸。の風に吹かれて) 第12回 「西海岸。の昭和!実験奮闘記」(続西海岸。の風に吹かれて) 第11回 「西海岸。の昭和!実験奮闘記」(続西海岸。の風に吹かれて) 第10回 「西海岸。の昭和!実験奮闘記」(続西海岸 ...
