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コーヒーブレイク qPCR試薬の蛍光強度を比較してみた! ■はじめに qPCRの蛍光強度、普段どの程度意識されていますか? qPCRの結果を評価する際、Ct値や増幅曲線に注目される方は多いかと思いますが、実は蛍光強度も重要な指標のひとつです。 蛍光強度が高いと、Ct値の判定が安定しやすくなり、ピペッティング誤差などの技術的なばらつきにも強く、再現性の高い定量が可能になります。しかしながら、この点は ...
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コーヒーブレイク ロング PCR の特異性を上げるコツ! ■はじめに 近頃はショートリードだけでなく、ロングリードシーケンスも盛んに行われるようになりましたね。中でも、特定の領域をPCRによって増幅してシーケンスするアンプリコンシーケンスは、コストやデータ量を抑えて特定の領域を解析できる手法です。 ただ、ロングPCRの際に、バンドがスメアになる、目的以外のバンドが出る、といった経験をした方も多いの ...
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コーヒーブレイク インフルエンザウイルスを検出してみた! ■はじめに 今年最後の実験レポートは冬らしいものということで、インフルエンザウイルスをqRT-PCRで検出した実施例のご紹介です。 インフルエンザウイルスや新型コロナウイルスなどのRNAウイルスはqRT-PCRで検出可能です。qRT-PCRには1-step法と2-step法があり、以下のような違いがあります。 RNAウイルスの検出用途では操 ...
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コーヒーブレイク KODEasy® を使ってPCR産物をナノポアシークエンスしてみた! ■はじめに ロングリードシークエンス、最近盛り上がっていますよね。 なかでも Oxford Nanopore Technologies(ナノポア)のシークエンスは、手軽に測定を始められ、リアルタイムにデータを確認できる(迅速な解析ができる)点でも注目されていますね。 一方で、シークエンスのライブラリー調製は依然 ...
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コーヒーブレイク GCリッチな微生物ゲノムからNGSライブラリーを調製してみた! ■はじめに このたび、東洋紡からTransposaseを利用したNGSライブラリー調製キット「GenNext®Transposase-based DNA Library Prep Kit [Code No. TNP-101]」を新しく発売いたしました! 本キットは精製1回のみのシンプルな操作でライブラリー調製が可能で ...
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コーヒーブレイク コーヒーブレイク お楽しみコラム 「ヒミツの実験レポート」 Index GCリッチな微生物ゲノムからNGSライブラリーを調製してみた! KODEasy® を使ってPCR産物をナノポアシークエンスしてみた! インフルエンザウイルスを検出してみた! ロング PCR の特異性を上げるコツ! qPCR試薬の蛍光強度を比較してみた! 細胞から直接cDNA合成してバラツキを比較してみた! ア ...
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コーヒーブレイク コーヒーブレイク お楽しみコラム 「ヒミツの実験レポート」 Index GCリッチな微生物ゲノムからNGSライブラリーを調製してみた! KODEasy® を使ってPCR産物をナノポアシークエンスしてみた! インフルエンザウイルスを検出してみた! ロング PCR の特異性を上げるコツ! qPCR試薬の蛍光強度を比較してみた! 細胞から直接cDNA合成してバラツキを比較してみた! ア ...
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コーヒーブレイク 「再三 西海岸。の風に吹かれて」 第30回 「再三 西海岸。の風に吹かれて」 第29回 「再三 西海岸。の風に吹かれて」 第28回 「再三 西海岸。の風に吹かれて」 第27回 「再三 西海岸。の風に吹かれて」 第26回 「再三 西海岸。の風に吹かれて」 第25回 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第24回 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第23回 「また、西海岸。の風に吹かれて ...
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コーヒーブレイク 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第20回 「また、西海岸。の風に吹かれて」 第19回 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第18回 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第17回 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第16回 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第15回 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第14回 「続々:西海岸。の風に吹かれて」 第13回 「西海岸。の昭和!実験奮闘記」 ...
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コーヒーブレイク 「西海岸。の昭和!実験奮闘記」(続西海岸。の風に吹かれて) 第10回 「西海岸。の昭和!実験奮闘記」(続西海岸。の風に吹かれて) 第9回 「西海岸。の昭和!実験奮闘記」(続西海岸。の風に吹かれて) 第8回 「西海岸。の昭和!実験奮闘記」(続西海岸。の風に吹かれて) 第7回 「西海岸。の風に吹かれて」 第6回 「西海岸。の風に吹かれて」 第5回 「西海岸。の風に吹かれて」 第4回 ...
