実施例

RamDA-seq 実施例6 ランダムプライマーおよびNSR プライマー を用いた場合の rRNA混入率の比較

cDNAを合成する際に、通常のランダムプライマーを用いた場合と、NSR(Not so random) プライマー を用いた場合の rRNA混入率の比較を行いました。

【実験方法】
GenNext^® RamDA-seq^® Single Cell Kit [Code No. RMD-101]を用い、Kitに付属の RT-RamDA^® Primer Mix と、別売りの NSR Primer Set for mouse [Code No. NSR-102]にて、NIH3T3細胞から抽出したTotal RNA (10pg、1ng) から cDNA、二本鎖DNAを合成しました。その後、Nextera^® XT DNA Library Preparation Kitを用いてライブラリーを調製し、illumina^® MiSeq^®でシーケンスを行いました。

【実験結果】
Total RNA量 10pg、1ng ともにNSR Primer Setを用いた場合の方がrRNA混入率が低い
結果となりました。

NSRプライマーをご使用いただくことで、ランダムプライマーよりもrRNA混入率を
下げることが可能です。

ヒト由来のサンプルにはNSR Primer Set for human [Code No. NSR-101] を、マウス由来
のサンプルにはNSR Primer Set for mouse [Code No. NSR-102] のご使用をお勧めします。

※RamDA-seq^®とRT-RamDA^® は国立研究開発法人理化学研究所の登録商標です。

RamDA-seq 製品ページ
実施例一覧ページ