実施例
KOD FX 実施例41 微量DNAからのPacBio社 SMRTbell® ライブラリー調製
PacBio社のHiFiシーケンスにおいて、わずか1ngのDNAからシーケンス解析ができるプロトコルが公開され、ライブラリーの増幅にKOD Xtreme Hot start DNA Polymerase*、KOD FXが採用されました。
* KOD Xtreme Hot start DNA PolymeraseはTOYOBOとEMD Millipore Corp.のCo-brand品で日本外で販売されている商品となります。
ロングリードのシーケンスは高精度なアセンブリを実現でき、注目されています。
しかしながら、微量DNAからのロングリードシーケンスは難しいとされていました。
今回、KOD Xtreme、KOD FXを使用することで、わずか1ngのDNAからロングリードのシーケンス解析が可能になりました。他社ポリメラーゼと比較し、バイアスが低減され、より連続されたゲノムアセンブリが得られることが確認されています。
KOD Xtreme、KOD FXを用いたPacBio社Ampli-Fiプロトコルは こちら
"Amplifying genomic DNA for SMRTbell® library preparation and HiFi sequencing"
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