実施例
KOD One 実施例8 哺乳動物細胞用発現ベクターにクローニングされた遺伝子配列への3塩基変異導入
データご提供 : 広島大学大学院 医歯薬保健学研究院 産科婦人科教室 助教 杉本 潤 様
<実験の目的>
哺乳動物細胞用発現ベクターにクローニングされた遺伝子Aに対しアミノ酸置換を誘発する3塩基の変異導入を行う。
<実験方法>
【サンプル】
プラスミド:哺乳動物細胞用発現ベクター(約7.1kb)に遺伝子A(約1.8kb)をクローニングしたプラスミド
【サンプルの調製方法】
Qiagen midi kit で抽出、精製したプラスミドDNA
【遺伝子名とターゲット長】
遺伝子A : 1.8kb, ベクター : 7.1kb
【プライマー】
変異導入用プライマーForward (31 base)
変異導入用プライマーReverse (31 base)
【反応液組成】 【PCRサイクル】
(μL) | ||||||
滅菌蒸留水 | 10.5 | 98℃ 10sec. | ||||
KOD One® PCR Master Mix | 12.5 | 55℃ 15sec. | 30cycles | |||
10μM Primer F | 0.5 | 72℃ 40sec. | ||||
10μM Primer R | 0.5 | |||||
50pg/μL プラスミドDNA | 1 | |||||
Total Volume | 25 |
【測定機器】
GeneAmp PCR system 9700
<結果・考察>
<感想・ご意見等>
当研究室で使用している哺乳動物細胞用発現ベクターは、その大きさと特徴的な配列により、クローニングされた遺伝子配列への直接的な変異導入が困難であった。このことから、違うベクター(pGEM-Tなど)にクローニングした遺伝子配列へ変異を導入後、この変異を含むDNA断片を切り出し、哺乳動物細胞用発現ベクターに再クローニングする必要があった。しかし、KOD One を用いることにより直接変異を導入することが可能となり、時間、労力の短縮につながった。また、変異の導入効率は調べた数クローン中100%であり、近傍の配列にPCRエラーは確認されなかった。
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