トランスポゼース使用次世代シーケンサー用ライブラリー調製キット
GenNext® Transposase-based DNA Library Prep Kit
- NEW ITEM
TOYOBO
価格表
用途
●DNA-seq用 ライブラリー調製
●RNA-seq用 ライブラリー調製
(本キットとGenNext® RamDA-seq® Single Cell Kit [Code No.RMD-101, RMD-101T]との組み合わせ)
説明
本製品は微量の二本鎖DNAから簡便かつ迅速に次世代シーケンス解析(NGS)用のライブラリー調製を行うためのキットです。
特長
●微量DNAからライブラリー調製可能
100 pg~10 ng DNAに対応可能です(1 ngを推奨)。
●断片化されていないDNAにも対応
トランスポゼースによる断片化・タグメント化反応を利用するため、断片化されていないDNAをサンプルとして使用可能です。
●簡便、迅速、高効率にライブラリーを調製
独自のライブラリー調製法を採用しており、2時間以内で高効率なライブラリー調製が可能です。
実施例
1.ライブラリー収量の比較
大腸菌ゲノムDNA 1ngから、GenNext® Transposase-based DNA Library Prep Kit および、他社トランスポゼースベースのライブラリー調製キットでライブラリーを 調製し、PCRは12サイクルで行い、シーケンスはMiSeq® (イルミナ社)で実施しました。 その結果、他社と比較して同等の収量となり、いずれもイルミナ社シーケンサーに供するために必要な4nM以上の収量が得られました。
2.ライブラリーカバレッジの比較
HB8 (Tth) ゲノムDNA 1ngから、 GenNext® Transposase-based DNA Library Prep Kit および、他社トランスポゼースベースのライブラリー 調製キットでライブラリーを調製し、GC含有率における カバレッジを確認しました。 PCRは12サイクルで行い、 シーケンスはMiSeq®(イルミナ社)で実施しました。 その結果、他社ライブラリー調製試薬を用いた場合と比べて、 ノーマライズされたカバレッジが1に近く、バイアスが少ない結果となりました。
- 製品内容
【TNP-101T】 Tagmentation Buffer 37.5μL×1本 Transposase for Tagmentation 30μL×1本 Additional Solution 30μL×1本 Gap Repair Buffer 156μL×1本 Gap Repair Enzyme Mix 54μL×1本 KOD Master Mix 120μL×1本
【TNP-101】 Tagmentation Buffer 150μL×1本 Transposase for Tagmentation 120μL×1本 Additional Solution 120μL×1本 Gap Repair Buffer 624μL×1本 Gap Repair Enzyme Mix 216μL×1本 KOD Master Mix 480μL×1本
【TNP-101L】 Tagmentation Buffer 300μL×1本 Transposase for Tagmentation 240μL×1本 Additional Solution 240μL×1本 Gap Repair Buffer 1,248μL×1本 Gap Repair Enzyme Mix 432μL×1本 KOD Master Mix 960μL×1本
※アダプターと精製用磁性ビーズは含まれておりません。
磁性ビーズ
Agencourt® AMPure® XP試薬 (ベックマンコールター社)カタログ番号:A63880、A63881等を推奨します。
アダプター
インデックスを有するIllumina® Nextera XT Library Prep Kit などのライブラリー作製で一般的に使用されるアダプターが使用できます。
(例)Nextera XT Index Kit(24 Indexes, 96 Samples)カタログ番号:FC-131-1001, Nextera XT Index Kit v2 Set A-D(96 Indexes, 384 Samples)カタログ番号:FC-131-2001~4
- 基本反応条件
-
断片化・タグメント化反応
↓
Additional & Gap Repair反応
↓
ライブラリーエンリッチメント
↓
ライブラリーの精製
※詳細は取扱説明書をご覧ください。
本キットをGenNext® RamDA-seq® Single Cell Kit [Code No. RMD-101, RMD-101T] と組み合わせて使用する場合は、該当キットの取扱説明書をご参照ください。その場合は1/2スケールで反応することになるため、使用回数は12→24、48→96、96→192回となります。
- ※ 法規制について
- 毒： 毒物及び劇物取締法[医薬用外毒物]
- 国： 国民保護法[毒素]
- 劇： 毒物及び劇物取締法[医薬用外劇物]
- 組： カルタヘナ法(遺伝子組換え生物等の使用等の規制による
- 危： 消防法[危険物]
- 生物の多様性の確保に関する法律）
- Ｐ： PRTR法（化学物質排出把握管理促進法）[届け出義務物質]
- 申： ご購入時に申込書の提出が必要な製品
- 労： 労働安全衛生法[通知または表示義務物質]
- なし： 上記法令や申込書の提出に該当しない製品
