Marker Gene Detection Kit
TOYOBO
価格表
用途
● 実験動物用遺伝子マーカー検出
説明
本製品は、理化学研究所バイオリソースセンターにて開発され |
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特長
● さまざまなサンプルを用いて高効率にトランスジーンを検出することができます。
【表1 検出対象動物および使用可能サンプル】
検出対象動物種 | 使用可能サンプル |
マウス | マウス尾(テール)・耳・培養細胞 |
ラット | マウス尾(テール)・耳・培養細胞 |
ヒト | 培養細胞 |
※ 上記以外の動物種では内部標準に使用しているトランスフェリンレセプター遺伝子が検出されません。
マウス、ラット、ヒト以外の動物種のサンプルからは内部標準として使用しているトランスフェリン
レセプター遺伝子は増幅されませんが、基本的に表2記載の遺伝子を検出することは可能です。
● 9種類のトランスジーンを同時に検出できます。
【表2 検出対象遺伝子】
遺伝子名 |
略称 | 備考 | 対象配列 |
トランスフェリンレセプター遺伝子 |
Tfrc (IC) |
内部標準 |
NM_011638 |
βガラクトシダーゼ遺伝子 |
lacZ |
レポーター遺伝子 |
NC_011750 |
フリッパーゼ遺伝子 |
flp |
組換え酵素 |
U46493 |
Creリコンビナーゼ遺伝子 |
cre | 組換え酵素 |
NC_005856 |
ハイグロマイシン耐性遺伝子 |
hyg |
薬剤耐性遺伝子 |
V01499 |
ピューロマイシン耐性遺伝子 |
puro |
薬剤耐性遺伝子 |
M25346 |
ネオマイシン耐性遺伝子 |
neo |
薬剤耐性遺伝子 |
NC_008460 |
GFP (Green fluorescence protein) |
GFP |
蛍光タンパク質 |
U55763 |
Cas9 (CRISPR associated protein 9) |
cas9 |
切断酵素 | 3) |
IRES (Internal Ribosome Entry Site) |
IRES |
リボソーム進入部位 |
X74312 |
【表3 検出されるバリアント】
本キットでは以下の検出対象遺伝子のバリアントも検出されます。
検出されるGFPバリアント |
検出されるFLPバリアント |
EGFP (Enhanced Green fluorescent protein) |
FLPe |
※ 本キットで使用しているプライマーは表2に記載のGenBank等の配列を基に設計されています。
表3に示すように主なバリアントに関しては検出されますが、部分配列の挿入やコドンユーセージが
変更されている場合は検出できない場合もございます。予めご了承ください。
実施例
マウステールライセートを用いたマーカー遺伝子の検出
標準プロトコールとハイスループットプロトコールを用いて、下記系統のマウスのテールライセートを用いてマーカー遺伝子の検出を行いました。
【解析したマウスの系統】
マウス系統 |
マーカー遺伝子の有無 |
系統 1 |
- |
系統 2 |
cre, GFP |
系統 3 |
hyg, neo, GFP |
系統 4 |
lacZ, neo, IRES |
①標準プロトコールを用いた解析結果
②ハイスループットプロトコールを用いた解析結果
※内部標準(IC)として増幅します。マウス、ラット、ヒトのトランスフェリンレセプター遺伝子を増幅するように設計されています。
ICの増幅サイズは動物種により異なります。(マウス 1073 bp、ラット1071 bp、ヒト 1134 bp)
参考文献
1) Nakata H et al., Exp. Anim., 58: 437-442 (2009)
2) 吉木 淳, 実験動物技術:第49巻1号35-40 (2014)
3) A human codon-optimized SpCas9 Cong L et al., Science , 339(6121):819-23 (2013)
- 製品内容
●Primer and Control template
Primer Set 1 1.2 mL×1本
Primer Set 2 1.2 mL×1本
Control template 100μL×1本
●KOD FX Neo [Code: KFX-201]*
KOD FX Neo 200μL×1本
2×PCR Buffer for KOD FX Neo
1.7mL×3本
2 mM dNTPs 1mL×2本
*KOD FX Neo [Code: KFX-201]が1セット含まれます。
※50μLで反応を行なった場合、200反応用としてご使用になれます。
- 注意事項
PCRには製品に添付されているdNTPsまたは別売りのdNTPs Mixture (2mM) [NTP-201]をご使用ください。他のdNTPsでは、十分な性能が得られない場合があります。
- ※ 法規制について
- 毒: 毒物及び劇物取締法[医薬用外毒物]
- 国: 国民保護法[毒素]
- 劇: 毒物及び劇物取締法[医薬用外劇物]
- 組: カルタヘナ法(遺伝子組換え生物等の使用等の規制による
- 危: 消防法[危険物]
- 生物の多様性の確保に関する法律)
- P: PRTR法(化学物質排出把握管理促進法)[届け出義務物質]
- 申: ご購入時に申込書の提出が必要な製品
- 労: 労働安全衛生法[通知または表示義務物質]
- なし: 上記法令や申込書の提出に該当しない製品