実施例

RamDA-seq 実施例5 検出転写産物数の比較およびRNA種類別リード数の検証

mES total RNA 10pgからGenNext^® RamDA-seq^® Single Cell Kit [Code No. RMD-101] およびA社キットにて、cDNA、二本鎖DNAを合成し、次世代シーケンサー解析を行いました。GenNext^® RamDA-seq^® Single Cell Kit ではプライマーとしてNSR Primer set for mouseを使用しています。GenNext^® RamDA-seq^® Single Cell Kit では不要であるcDNA増幅のためのPCRをA社キットでは、18サイクル実施しました。その後、Nextera^® XT DNA Sample Preparation Kitを用いてライブラリーを調製し、illumina^® MiSeq^®でシーケンスを行いました。 その結果、A社キットに比べてGenNext^® RamDA-seq^® Single Cell Kit の方が、約5,000遺伝子をより多く検出することができました。



※RamDA-seq^®とRT-RamDA^® は国立研究開発法人理化学研究所の登録商標です。

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