実施例

KOD FX 実施例24 ヒト糞便から精製したDNAを用いた Helicobacter pylori cagA遺伝子の増幅

【遺伝子名】
Helicobacter pylori cagA

【サンプル】
ヒトの糞便からQIAmp DNA stool mini kit (QIAGEN)を用い精製したDNA

【ターゲット長】
239bp

【プライマー条件】
1st PCR Forward:AACCAATCGTTGATAAGAAYGATAG
1st PCR Reverse:TGTTGATTTTAGAYGGATCKTTTTG

2nd PCR Forward:GAAYGATAGGGATAAYAGGC
2nd PCR Reverse:CKTTTTGAWGRGACACCCAA
(K:G/T,Y:C/T,W:A/T)

【サイクル】

●A社　PCR試薬
95 ℃ 10min.
↓
(94 ℃ 30sec.,50 ℃ 60sec.,72 ℃ 30sec.)×30Cycles

●KOD -Plus-
94 ℃ 2min.
↓
(94 ℃ 15sec.,53 ℃ 30sec.,68℃ 30sec.)×40Cycles

●KOD  FX (1st PCR)
94 ℃ 2min.
↓
(98 ℃ 10sec.,55 ℃ 30sec.,68℃ 30sec.)×50Cycles

●KOD  FX (2nd PCR)
94 ℃ 2min.
↓
(98 ℃ 10sec.,56 ℃ 30sec.,68℃ 30sec.)×50Cycles

【データご提供】
大阪大学大学院 医学系研究科
保健学専攻 生体情報科学講座
山本　容正先生、平井　到先生、紀本　愛先生
　
【先生からのコメント】
KOD FXを用いる前に幾つかの酵素を使用して条件を検討していましたが、満足できる増幅は得られておりませんでした。KOD FXを使用した場合、増幅も特異性も著しく向上したと考えております。

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