KOD SYBR qPCR Mix実施例1
プロモーター近傍配列の増幅

先生方からいただきました実施例を掲載いたしております。実験にお役立てください。



【サンプル】ゲノムDNA

【遺伝子名】Homo sapiens telomerase RNA (TR) gene, promoter and complete squence

CCCGCCCGAGAGAGTGACTCTCACGAGAGCCGCGAGAGTCAGCTTGGCC
AATCCGTGCGGTCGGCGGCCGCTCCCTTTATAAGCCGACTCGCCCGGCAG
CGCACCGGGTTGCGGAGGGTGGGCCTGGGAGGGGTGGTGGCCATTTTTTG
TCTAACCCTAACTGAGAAGGGCGTAGGCGCCGTGCTTTTGCTCCCCGCGC
GCTGTTTTTCTCGCTGACTT


【プライマー】
F: CCCGCCCGAGAGAGTGAC (18bp, Tm: 68.56℃)
R: AAGTCAGCGAGAAAAACAGC (20bp, Tm: 61.12℃)
※ChIP法の論文より引用しました。

【ターゲット長】216 bp

【反応条件】
DW                                        X  μL
KOD SYBR qPCR Mix            10  μL
Primer F                                 4  pmole       
Primer R                                 4  pmole
50xROX reference dye             0.4μL
Template DNA                         Y μL  
                          20 μL

【PCRサイクル】
98℃, 2 min.

(98℃, 10 sec. - 60℃, 10 sec. - 68℃, 30 sec.) × 40 cycles
*Date collectionは伸長ステップに設定しました。